主人公・伏見葵は秋から全寮制の学園へ編入する。その準備もあって、夏休み中に学園の寮へ引っ越すことになった。学園があるのは、彼の家から遠く遠く離れた南の島。昔、父親が教壇に立っていた学園だから、親元から離れた寮暮らしでも許してもらえたのだった。船でしか行けない南の島。渡航中、嵐に遭ったりと大変だったけれど、なんとか到着。夏休みにもかかわらず、学園の寮に残っていた三人の女の子。明るく自由奔放で、尊大な性格――天鳥すみれ誰にでも優しく、朗らかでおっとり――水崎月乃凛としているしっかり者だが、実は慌て者――高瀬このはさらに彼の編入を阻止するべく妹が追いかけてきたことも発覚し、島はさらに賑やかになる。兄限定で、甘えるのも甘やかすのも大好き――伏見巴島内を案内してもらったり、海水浴をしたり、編入準備のために勉強を教えてもらったり、雨の日は図書館で過ごしたり。毎日がたくさんのことで満たされていた。――しかし、夏休みはなかなか終わらない。その不思議なことに気づいた葵は、島の秘密を探ることになるのだが……