効果のほどはよくわかりません

やや過密飼育気味なのですぐに汚れてしまいますが、
効果のほどは目にみえないのでよくわかりません。
水流を弱めるために排水口にフィルターマットを小さく切ったものをつけているのですが、
それが真っ黒に汚れていることがあります。